पावसाळ्यात जनावरे व गोठा स्वच्छ ठेवणे अवघड जाते. अशा परिस्थितीत जनावराला आजार होण्याची शक्यता जास्त असते. उदाहरणार्थ, थॅनिला रोग. गोठा स्वच्छ न ठेवल्याने कासेचे संसर्ग रोग होण्याचा धोका वाढतो. कधीकधी कास सुजल्याने दूध येणे बंद होते किंवा दूध उत्पादनात घट येते.