टमाटर के अच्छे उत्पादन के लिए खाद एवं उर्वरकों का उपयोग मृदा परीक्षण के आधार पर करना चाहिए। सामान्यतौर पर टमाटर की खेती के लिए 100 क्विंटल प्रति एकड़ अच्छी सड़ी हूई गोबर खाद, 50 किलोग्राम डीएपी, 50 किलोग्राम अमोनियम सल्फेट, 40 किलोग्राम म्यूरेट ऑफ पोटाश प्रति एकड़ रोपाई के पूर्व खेत मे मिलाएं। यदि मृदा में ज़िंक की कमी हो तो 10 किलोग्राम ज़िंक सलफेट प्रति एकड़ रोपाई के पूर्व खेत मे दें। इसके बाद 35 किलोग्राम यूरिया प्रति एकड़ रोपाई के 30 और 60 दिन बाद दें।